برخی نمونه ها مانند ادرار، مدفوع و خلط می توانند به حالتی که بدن به صورت طبیعی آنها را دفع می نماید جمع آوری گردند در حالیکه مایع منی توسط بیمار قابل جمع آوری است. جمع آوری برخی نمونه ها از بچه های کوچک یا بیماران با محدودیت فیزیکی ممکن است نیاز به یاری داشته باشد. معمولاً جمع آوری این نمونه ها بدون درد می باشد، اما کسب آنها گاهاً خجالت آور و ناخوشایند است زیرا شامل دفع ضایعات بدن بوده و شامل بخش ها و اعمالی از بدن هستند که مردم ترجیح می دهند به صورت خصوصی انجام شود.
گاهی اوقات این نمونه ها را می توان در خانه جمع آوری کرد و به مطب پزشک یا مرکز پزشکی آورد، اما همچنین ممکن است اینها در یک مرکز پزشکی مانند مطب پزشک، درمانگاه، مرکز خدمات آزمایشگاهی بیماران یا بیمارستان جمع آوری گردند. این تسهیلات معمولاً برای به حداقل رساندن سروکار داشتن بیمار با نمونه و احساس خجالت طراحی می شوند. مثلا، ممکن است در آن مراکز شما دریچه ای را در سرویس های بهداشتی برای قراردادن نمونه ها ببینید که دیگر لازم نیست با ظرفی شفاف پر از نمونه وارد سالن عمومی شوید. ممکن است دستورالعمل های چاپی را که در سرویس های بهداشتی نصب شده اند پیدا کنید که درباره چگونگی جمع آوری نمونه های ادرار یا مدفوع توضیح داده اند و دیگر لازم نیست که مسئول آزمایشگاه یا پرستار واضحاً به شما توضیح دهد که چگونه نمونه ادرار یا مدفوع "تمیز clean catch" را جمع آوری کنید. اگر نسبت به این موارد حساس هستید و می خواهید که مرکز خدمات بهداشتی یا مراکز آزمایش را پیدا کنید که این گزینه ها را فراهم کنند، می توانید درباره شیوه ها، اصول و اقداماتی که توسط کارکنان جهت تضمین حریم خصوصی و راحتی بیماران انجام می شوند، پرسش نمائید.
در زیر مثال هایی از انواع نمونه ارائه شده اند که معمولاً توسط بیمار جمع آوری می شوند. بسیار مهم است که از تمام دستورالعمل های جمع آوری نمونه با دقت پیروی شود. پیش از جمع آوری نمونه، درباره درک کامل دستورالعمل ها مطمئن باشید.